Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC17Q9NVM6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJC17Q9NVM6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJC17Q9NVM6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms