Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM7SF3Q9NS93 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM7SF3Q9NS93 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM7SF3Q9NS93 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms