Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NECTIN3Q9NQS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NECTIN3Q9NQS3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NECTIN3Q9NQS3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN3Q9NQS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms