Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSX2Q9BZM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSX2Q9BZM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSX2Q9BZM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms