Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MTA3Q9BTC8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MTA3Q9BTC8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MTA3Q9BTC8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MTA3Q9BTC8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MTA3Q9BTC8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTA3Q9BTC8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms