Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF559Q9BR84 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF559Q9BR84 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF559Q9BR84 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF559Q9BR84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms