Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF354BQ96LW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF354BQ96LW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF354BQ96LW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF354BQ96LW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF354BQ96LW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms