Protein–RNA interactions for Protein: Q96HE9

PRR11, Proline-rich protein 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR11Q96HE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR11Q96HE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR11Q96HE9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR11Q96HE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR11Q96HE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR11Q96HE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRR11Q96HE9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRR11Q96HE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms