Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBEAQ8NFP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBEAQ8NFP9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NBEAQ8NFP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBEAQ8NFP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms