Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC29Q8NA56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC29Q8NA56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC29Q8NA56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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