Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA13Q8N1Q1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA13Q8N1Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA13Q8N1Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CA13Q8N1Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms