Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spice1Q8C804 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spice1Q8C804 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spice1Q8C804 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spice1Q8C804 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spice1Q8C804 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spice1Q8C804 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spice1Q8C804 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spice1Q8C804 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Spice1Q8C804 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spice1Q8C804 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spice1Q8C804 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms