Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM200AQ86VY9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200AQ86VY9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM200AQ86VY9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM200AQ86VY9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms