Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD2Q7Z408 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD2Q7Z408 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSMD2Q7Z408 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms