Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q5VSD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q5VSD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q5VSD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q5VSD8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q5VSD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q5VSD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q5VSD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q5VSD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q5VSD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5VSD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q5VSD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q5VSD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q5VSD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q5VSD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5VSD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5VSD8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q5VSD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5VSD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5VSD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5VSD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5VSD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q5VSD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q5VSD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q5VSD8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q5VSD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q5VSD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q5VSD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q5VSD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms