Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
FRMPD1Q5SYB0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
FRMPD1Q5SYB0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FRMPD1Q5SYB0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FRMPD1Q5SYB0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms