Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM48Q5RL73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM48Q5RL73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM48Q5RL73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM48Q5RL73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM48Q5RL73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.5 ms