Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIPR1Q53HC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIPR1Q53HC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIPR1Q53HC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIPR1Q53HC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIPR1Q53HC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms