Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPROQ16827 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPROQ16827 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPROQ16827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPROQ16827 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPROQ16827 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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