Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC23AQ15436 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC23AQ15436 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC23AQ15436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEC23AQ15436 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC23AQ15436 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC23AQ15436 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC23AQ15436 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC23AQ15436 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC23AQ15436 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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