Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC41Q15345 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC41Q15345 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC41Q15345 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC41Q15345 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC41Q15345 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC41Q15345 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms