Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBI3Q14213 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EBI3Q14213 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBI3Q14213 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBI3Q14213 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms