Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX6Q13608 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX6Q13608 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX6Q13608 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX6Q13608 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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