Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRQ13535 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRQ13535 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRQ13535 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRQ13535 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRQ13535 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRQ13535 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRQ13535 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRQ13535 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRQ13535 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRQ13535 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRQ13535 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRQ13535 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRQ13535 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRQ13535 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRQ13535 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRQ13535 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRQ13535 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRQ13535 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRQ13535 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRQ13535 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRQ13535 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRQ13535 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRQ13535 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRQ13535 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRQ13535 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATRQ13535 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATRQ13535 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATRQ13535 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRQ13535 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRQ13535 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRQ13535 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATRQ13535 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRQ13535 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRQ13535 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRQ13535 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRQ13535 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRQ13535 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRQ13535 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRQ13535 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRQ13535 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRQ13535 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRQ13535 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRQ13535 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRQ13535 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATRQ13535 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRQ13535 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRQ13535 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRQ13535 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRQ13535 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRQ13535 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRQ13535 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRQ13535 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRQ13535 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRQ13535 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRQ13535 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRQ13535 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRQ13535 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRQ13535 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRQ13535 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRQ13535 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRQ13535 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRQ13535 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRQ13535 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRQ13535 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRQ13535 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRQ13535 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRQ13535 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRQ13535 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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