Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAF1BQ13112 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHAF1BQ13112 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1BQ13112 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1BQ13112 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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