Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROAPQ12815 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TROAPQ12815 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TROAPQ12815 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROAPQ12815 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROAPQ12815 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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