Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 YJL160CYJL160C 864 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 MET22YOL064C 1074 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 Q0010Q0010 387 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 TMS1YDR105C 1422 nt8.95□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 YIR035CYIR035C 765 nt8.94□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 MRS4YKR052C 915 nt8.94□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 CAK1YFL029C 1107 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 OLA1YBR025C 1185 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 OCH1YGL038C 1443 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 DUR3YHL016C 2208 nt8.93□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 POP2YNR052C 1302 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 RRT14YIL127C 621 nt8.92□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.91□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 YMR210WYMR210W 1350 nt8.9□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 YJR149WYJR149W 1215 nt8.9□□□□□ -0.98
SMC6Q12749 PDC6YGR087C 1692 nt8.89□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 EMC3YKL207W 762 nt8.89□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 RNA170RNA170 169 nt8.89□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 TPN1YGL186C 1740 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 AAT1YKL106W 1356 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 PET18YCR020C 648 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 YJL009WYJL009W 327 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 BUB2YMR055C 921 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 TOK1YJL093C 2076 nt8.88□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 LPD1YFL018C 1500 nt8.87□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 ORT1YOR130C 879 nt8.87□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 DUS3YLR401C 2007 nt8.85□□□□□ -0.99
SMC6Q12749 YBR056WYBR056W 1506 nt8.83□□□□□ -1
SMC6Q12749 PUS7YOR243C 2031 nt8.82□□□□□ -1
SMC6Q12749 GRH1YDR517W 1119 nt8.82□□□□□ -1
SMC6Q12749 YER156CYER156C 1017 nt8.82□□□□□ -1
SMC6Q12749 TRP2YER090W 1524 nt8.81□□□□□ -1
SMC6Q12749 snR86snR86 1004 nt8.81□□□□□ -1
SMC6Q12749 MFT1YML062C 1179 nt8.81□□□□□ -1
SMC6Q12749 snR4snR4 186 nt8.81□□□□□ -1
SMC6Q12749 RHO1YPR165W 630 nt8.8□□□□□ -1
SMC6Q12749 HXT11YOL156W 1704 nt8.8□□□□□ -1
SMC6Q12749 ADE16YLR028C 1776 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 YPR084WYPR084W 1371 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 YPT31YER031C 672 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 BUD20YLR074C 501 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 BXI1YNL305C 894 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 PAU21YOR394W 495 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 RPS6AYPL090C 711 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 PAU22YPL282C 495 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 RPS6BYBR181C 711 nt8.79□□□□□ -1
SMC6Q12749 MEP1YGR121C 1479 nt8.78□□□□□ -1
SMC6Q12749 UTR5YEL035C 501 nt8.78□□□□□ -1
SMC6Q12749 THI6YPL214C 1623 nt8.78□□□□□ -1
SMC6Q12749 GNP1YDR508C 1992 nt8.77□□□□□ -1
SMC6Q12749 MRP1YDR347W 966 nt8.76□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YMR206WYMR206W 942 nt8.76□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 ADA2YDR448W 1305 nt8.76□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 THI73YLR004C 1572 nt8.75□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 HRA1HRA1 564 nt8.75□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YOR343CYOR343C 327 nt8.75□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 PUP3YER094C 618 nt8.74□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.74□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.74□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.74□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 GDH1YOR375C 1365 nt8.73□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 YLR072WYLR072W 2082 nt8.73□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 SHC1YER096W 1539 nt8.72□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 ATP2YJR121W 1536 nt8.72□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 EHT1YBR177C 1356 nt8.72□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 FRA1YLL029W 2250 nt8.71□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 SRM1YGL097W 1449 nt8.71□□□□□ -1.01
SMC6Q12749 LRO1YNR008W 1986 nt8.7□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YIL177CYIL177C 5277 nt8.7□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YJR154WYJR154W 1041 nt8.7□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 TAD2YJL035C 753 nt8.69□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 MET30YIL046W 1923 nt8.69□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 PFS2YNL317W 1398 nt8.69□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.68□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.68□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.68□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 TDH1YJL052W 999 nt8.67□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YNL190WYNL190W 615 nt8.67□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 ELP4YPL101W 1371 nt8.67□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.66□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 HIS3YOR202W 663 nt8.66□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 PRE10YOR362C 867 nt8.66□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 TIM50YPL063W 1431 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 FTH1YBR207W 1398 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 DIA4YHR011W 1341 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 PMU1YKL128C 888 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 RCF1YML030W 480 nt8.65□□□□□ -1.02
SMC6Q12749 HXT8YJL214W 1710 nt8.65□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 JHD1YER051W 1479 nt8.64□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 LEA1YPL213W 717 nt8.64□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 INO1YJL153C 1602 nt8.64□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 ALR1YOL130W 2580 nt8.64□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 NDE2YDL085W 1638 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 BUD31YCR063W 474 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.63□□□□□ -1.03
SMC6Q12749 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.63□□□□□ -1.03
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