Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 TMS1YDR105C 1422 nt9.56□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 YRF1-2YER190W 5046 nt9.56□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 RIM8YGL045W 1629 nt9.56□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 ATP2YJR121W 1536 nt9.56□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 YPT31YER031C 672 nt9.55□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 YMR206WYMR206W 942 nt9.55□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 FRA1YLL029W 2250 nt9.54□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 KAE1YKR038C 1161 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 YBL095WYBL095W 813 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 DMA2YNL116W 1569 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 MAE1YKL029C 2010 nt9.53□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 INH1YDL181W 258 nt9.52□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 TDH1YJL052W 999 nt9.52□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 ADE1YAR015W 921 nt9.52□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 TOS1YBR162C 1368 nt9.51□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 BUB2YMR055C 921 nt9.51□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 YMC2YBR104W 990 nt9.51□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 RHO1YPR165W 630 nt9.5□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 HMG2YLR450W 3138 nt9.5□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 YMR209CYMR209C 1374 nt9.5□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 MRS4YKR052C 915 nt9.49□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 Q0010Q0010 387 nt9.49□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 MFG1YDL233W 1377 nt9.49□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 YJL043WYJL043W 774 nt9.47□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 FUS3YBL016W 1062 nt9.47□□□□□ -0.89
SNU66Q12420 NUP53YMR153W 1428 nt9.46□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YJL009WYJL009W 327 nt9.45□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 THI73YLR004C 1572 nt9.45□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 HXT10YFL011W 1641 nt9.45□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 TPO4YOR273C 1980 nt9.44□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YHR218WYHR218W 1812 nt9.43□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YBR056WYBR056W 1506 nt9.43□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 NPP2YEL016C 1482 nt9.43□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 PUP3YER094C 618 nt9.43□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 TPN1YGL186C 1740 nt9.42□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 PET494YNR045W 1470 nt9.42□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YIL168WYIL168W 384 nt9.42□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 AGP3YFL055W 1677 nt9.42□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 PMU1YKL128C 888 nt9.4□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YRF1-3YGR296W 5580 nt9.4□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YRF1-6YNL339C 5580 nt9.4□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 YRF1-7YPL283C 5580 nt9.4□□□□□ -0.9
SNU66Q12420 SHC1YER096W 1539 nt9.4□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 URA8YJR103W 1737 nt9.39□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 TIM50YPL063W 1431 nt9.38□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 JHD1YER051W 1479 nt9.37□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 AAT1YKL106W 1356 nt9.37□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 BAP3YDR046C 1815 nt9.36□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 PRE10YOR362C 867 nt9.36□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 MEP1YGR121C 1479 nt9.35□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 CYT1YOR065W 930 nt9.35□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 EHT1YBR177C 1356 nt9.35□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 HOG1YLR113W 1308 nt9.34□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 YDR476CYDR476C 675 nt9.34□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 PRE5YMR314W 705 nt9.34□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 PSP2YML017W 1782 nt9.34□□□□□ -0.91
SNU66Q12420 PSD1YNL169C 1503 nt9.33□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 snR86snR86 1004 nt9.33□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.32□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 LRO1YNR008W 1986 nt9.31□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 HXT8YJL214W 1710 nt9.31□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 MTO1YGL236C 2010 nt9.29□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 RRT6YGL146C 936 nt9.29□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 HAC1YFL031W 717 nt9.28□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 SDH8YBR269C 417 nt9.28□□□□□ -0.92
SNU66Q12420 RCF1YML030W 480 nt9.26□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 CPT1YNL130C 1182 nt9.26□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 SPR1YOR190W 1338 nt9.25□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 PNS1YOR161C 1620 nt9.23□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 YPL247CYPL247C 1572 nt9.22□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 YIL177CYIL177C 5277 nt9.21□□□□□ -0.93
SNU66Q12420 YLR358CYLR358C 564 nt9.2□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 APT1YML022W 564 nt9.2□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 ARG7YMR062C 1326 nt9.2□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 YLR072WYLR072W 2082 nt9.2□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 BUD31YCR063W 474 nt9.19□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 NDE2YDL085W 1638 nt9.19□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 THI6YPL214C 1623 nt9.19□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 TRP2YER090W 1524 nt9.18□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 YGR137WYGR137W 375 nt9.18□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 WSC3YOL105C 1671 nt9.18□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 DIP5YPL265W 1827 nt9.18□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 YLR173WYLR173W 1827 nt9.17□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 RPR1RPR1 369 nt9.17□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 INO1YJL153C 1602 nt9.16□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 TDA4YJR116W 840 nt9.15□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 HIS3YOR202W 663 nt9.15□□□□□ -0.94
SNU66Q12420 FET5YFL041W 1869 nt9.15□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 YML079WYML079W 606 nt9.12□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 HXT11YOL156W 1704 nt9.11□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 NCA3YJL116C 1014 nt9.11□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 LEA1YPL213W 717 nt9.11□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 NBA1YOL070C 1506 nt9.1□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 ABP1YCR088W 1779 nt9.1□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 GLY1YEL046C 1164 nt9.1□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 TGL5YOR081C 2250 nt9.1□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 ARO3YDR035W 1113 nt9.09□□□□□ -0.95
SNU66Q12420 PUP2YGR253C 783 nt9.09□□□□□ -0.95
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