Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 MEP1YGR121C 1479 nt7.75□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 IPL1YPL209C 1104 nt7.73□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 CYC3YAL039C 810 nt7.72□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 SRP102YKL154W 735 nt7.72□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 YLR460CYLR460C 1131 nt7.72□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 RTG2YGL252C 1767 nt7.71□□□□□ -1.17
RPN6Q12377 DIA4YHR011W 1341 nt7.71□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 PFS2YNL317W 1398 nt7.7□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 YLR280CYLR280C 351 nt7.69□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 BUD31YCR063W 474 nt7.68□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 CHS7YHR142W 951 nt7.68□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 RNA170RNA170 169 nt7.67□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 NDE2YDL085W 1638 nt7.67□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 TIF3YPR163C 1311 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 INO1YJL153C 1602 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 ERO1YML130C 1692 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 MET30YIL046W 1923 nt7.66□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 GLY1YEL046C 1164 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 YNL140CYNL140C 570 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 MET22YOL064C 1074 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 OLA1YBR025C 1185 nt7.65□□□□□ -1.18
RPN6Q12377 GCD11YER025W 1584 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 HSV2YGR223C 1347 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 YNL190WYNL190W 615 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 LRO1YNR008W 1986 nt7.64□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 EHT1YBR177C 1356 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 YCR025CYCR025C 411 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 TDA4YJR116W 840 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 TGL5YOR081C 2250 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 PDC6YGR087C 1692 nt7.63□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 MRN1YPL184C 1839 nt7.62□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 DIP5YPL265W 1827 nt7.62□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 OCH1YGL038C 1443 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 SER2YGR208W 930 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 INM1YHR046C 888 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 SEN2YLR105C 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 MDH2YOL126C 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 YJL064WYJL064W 396 nt7.6□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 RCF1YML030W 480 nt7.6□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 SLM3YDL033C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 YMR166CYMR166C 1107 nt7.59□□□□□ -1.19
RPN6Q12377 PAU19YMR325W 375 nt7.58□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 HTS1YPR033C 1641 nt7.58□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 WSC3YOL105C 1671 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 GNP1YDR508C 1992 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 LAS17YOR181W 1902 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 CAK1YFL029C 1107 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 YGR210CYGR210C 1236 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 AIM34YMR003W 597 nt7.57□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 RHO1YPR165W 630 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 WSC4YHL028W 1818 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 SNU66YOR308C 1764 nt7.56□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 PUP3YER094C 618 nt7.55□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 ADE2YOR128C 1716 nt7.55□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 YGR137WYGR137W 375 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 MRP7YNL005C 1116 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 YPL108WYPL108W 507 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 MAS1YLR163C 1389 nt7.54□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 ALG7YBR243C 1347 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 NAP1YKR048C 1254 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 KTR4YBR199W 1395 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 PMT7YDR307W 1989 nt7.53□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 ECM10YEL030W 1935 nt7.52□□□□□ -1.2
RPN6Q12377 ARO3YDR035W 1113 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 RRT14YIL127C 621 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 SHC1YER096W 1539 nt7.52□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 THI73YLR004C 1572 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 LSP1YPL004C 1026 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 HXT8YJL214W 1710 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 ITR1YDR497C 1755 nt7.51□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 MAM3YOL060C 2121 nt7.5□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 PRC1YMR297W 1599 nt7.49□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 MET13YGL125W 1803 nt7.48□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 YPT31YER031C 672 nt7.48□□□□□ -1.21
RPN6Q12377 CHA1YCL064C 1083 nt7.46□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.46□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 SWM1YDR260C 513 nt7.45□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 YPL264CYPL264C 1062 nt7.45□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 TIM50YPL063W 1431 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 SNP1YIL061C 903 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 PRE10YOR362C 867 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 FCY1YPR062W 477 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 TOP3YLR234W 1971 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 BEM1YBR200W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 PMT1YDL095W 2454 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 SPE4YLR146C 903 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 ATP10YLR393W 840 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 ELP6YMR312W 822 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN6Q12377 YCP4YCR004C 744 nt7.41□□□□□ -1.22
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