Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 TOS1YBR162C 1368 nt8.16□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 NPP2YEL016C 1482 nt8.15□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 RHO1YPR165W 630 nt8.15□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 YPR084WYPR084W 1371 nt8.14□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 AAC3YBR085W 924 nt8.14□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 Q0010Q0010 387 nt8.14□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YJL009WYJL009W 327 nt8.13□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 TAD2YJL035C 753 nt8.13□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YJR154WYJR154W 1041 nt8.13□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 MRS4YKR052C 915 nt8.13□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YMR206WYMR206W 942 nt8.13□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YPT31YER031C 672 nt8.12□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 THI73YLR004C 1572 nt8.12□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 SHC1YER096W 1539 nt8.12□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 MEP1YGR121C 1479 nt8.12□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 TMS1YDR105C 1422 nt8.12□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 INH1YDL181W 258 nt8.11□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YIL168WYIL168W 384 nt8.11□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YIR035CYIR035C 765 nt8.11□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 BUB2YMR055C 921 nt8.11□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 ADE1YAR015W 921 nt8.1□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 AAT1YKL106W 1356 nt8.1□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 GID7YCL039W 2238 nt8.09□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 TDH1YJL052W 999 nt8.09□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 YOR268CYOR268C 399 nt8.09□□□□□ -1.11
LCB4Q12246 AGP3YFL055W 1677 nt8.08□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 TPN1YGL186C 1740 nt8.08□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 YJL043WYJL043W 774 nt8.07□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 ATP2YJR121W 1536 nt8.07□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 YOR072WYOR072W 315 nt8.06□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 YBR056WYBR056W 1506 nt8.05□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 EDC2YER035W 438 nt8.04□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 YRF1-2YER190W 5046 nt8.03□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 snR86snR86 1004 nt8.03□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 PUP3YER094C 618 nt8.03□□□□□ -1.12
LCB4Q12246 MTO1YGL236C 2010 nt8.02□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 PET494YNR045W 1470 nt8.01□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 NUP53YMR153W 1428 nt8.01□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 JHD1YER051W 1479 nt8□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 HXT8YJL214W 1710 nt7.99□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 NBA1YOL070C 1506 nt7.98□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.98□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 FUS3YBL016W 1062 nt7.98□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 LRO1YNR008W 1986 nt7.98□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 BAP3YDR046C 1815 nt7.98□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.97□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 MFG1YDL233W 1377 nt7.97□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 EHT1YBR177C 1356 nt7.97□□□□□ -1.13
LCB4Q12246 HAC1YFL031W 717 nt7.96□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 RRT6YGL146C 936 nt7.96□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 TRP2YER090W 1524 nt7.96□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 NCA3YJL116C 1014 nt7.95□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 TIM50YPL063W 1431 nt7.95□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 PRE10YOR362C 867 nt7.94□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 MEX67YPL169C 1800 nt7.94□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 THI6YPL214C 1623 nt7.93□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 PRE5YMR314W 705 nt7.93□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 APT1YML022W 564 nt7.92□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 SDH8YBR269C 417 nt7.92□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 INO1YJL153C 1602 nt7.92□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 MDL2YPL270W 2322 nt7.91□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 CSM2YIL132C 642 nt7.91□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 PSP2YML017W 1782 nt7.91□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 FET5YFL041W 1869 nt7.9□□□□□ -1.14
LCB4Q12246 ESBP6YNL125C 2022 nt7.9□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 PMU1YKL128C 888 nt7.89□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 HOG1YLR113W 1308 nt7.88□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 YLR358CYLR358C 564 nt7.88□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 PNS1YOR161C 1620 nt7.88□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 YDR476CYDR476C 675 nt7.87□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 RCF1YML030W 480 nt7.87□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 YPL247CYPL247C 1572 nt7.87□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 YLR072WYLR072W 2082 nt7.87□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 SPR1YOR190W 1338 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 DIP5YPL265W 1827 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 ABP1YCR088W 1779 nt7.86□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 HIS3YOR202W 663 nt7.85□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 HXT11YOL156W 1704 nt7.84□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 BUD31YCR063W 474 nt7.84□□□□□ -1.15
LCB4Q12246 PAB1YER165W 1734 nt7.83□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 ARO3YDR035W 1113 nt7.83□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 MIM1YOL026C 342 nt7.83□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 SRM1YGL097W 1449 nt7.83□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 ARG7YMR062C 1326 nt7.82□□□□□ -1.16
LCB4Q12246 CPT1YNL130C 1182 nt7.82□□□□□ -1.16
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