Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 SWM1YDR260C 513 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 HXT11YOL156W 1704 nt6.94□□□□□ -1.3
USB1Q12208 RIB1YBL033C 1038 nt6.94□□□□□ -1.3
USB1Q12208 SAM50YNL026W 1455 nt6.93□□□□□ -1.3
USB1Q12208 YBR056WYBR056W 1506 nt6.93□□□□□ -1.3
USB1Q12208 MIM1YOL026C 342 nt6.93□□□□□ -1.3
USB1Q12208 YMR210WYMR210W 1350 nt6.93□□□□□ -1.3
USB1Q12208 YGR210CYGR210C 1236 nt6.92□□□□□ -1.3
USB1Q12208 YMR166CYMR166C 1107 nt6.92□□□□□ -1.3
USB1Q12208 MET22YOL064C 1074 nt6.91□□□□□ -1.3
USB1Q12208 LPD1YFL018C 1500 nt6.91□□□□□ -1.3
USB1Q12208 ORT1YOR130C 879 nt6.9□□□□□ -1.3
USB1Q12208 YMR007WYMR007W 381 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 HIS3YOR202W 663 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 LEA1YPL213W 717 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 NDE2YDL085W 1638 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 HBS1YKR084C 1836 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 YLR072WYLR072W 2082 nt6.89□□□□□ -1.31
USB1Q12208 MEP1YGR121C 1479 nt6.88□□□□□ -1.31
USB1Q12208 OCH1YGL038C 1443 nt6.88□□□□□ -1.31
USB1Q12208 YPL108WYPL108W 507 nt6.88□□□□□ -1.31
USB1Q12208 PDC6YGR087C 1692 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 CAK1YFL029C 1107 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 YGR137WYGR137W 375 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 RRT14YIL127C 621 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 RCR1YBR005W 642 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 LSP1YPL004C 1026 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 FCY1YPR062W 477 nt6.87□□□□□ -1.31
USB1Q12208 SOD2YHR008C 702 nt6.86□□□□□ -1.31
USB1Q12208 GUT1YHL032C 2130 nt6.86□□□□□ -1.31
USB1Q12208 SRM1YGL097W 1449 nt6.85□□□□□ -1.31
USB1Q12208 YPT31YER031C 672 nt6.85□□□□□ -1.31
USB1Q12208 RNA170RNA170 169 nt6.85□□□□□ -1.31
USB1Q12208 YJL045WYJL045W 1905 nt6.85□□□□□ -1.31
USB1Q12208 BUD31YCR063W 474 nt6.84□□□□□ -1.31
USB1Q12208 RCF1YML030W 480 nt6.84□□□□□ -1.31
USB1Q12208 RHO1YPR165W 630 nt6.84□□□□□ -1.31
USB1Q12208 INO1YJL153C 1602 nt6.83□□□□□ -1.32
USB1Q12208 MEX67YPL169C 1800 nt6.83□□□□□ -1.32
USB1Q12208 STF1YDL130W-A 261 nt6.83□□□□□ -1.32
USB1Q12208 TDA4YJR116W 840 nt6.83□□□□□ -1.32
USB1Q12208 YNL140CYNL140C 570 nt6.83□□□□□ -1.32
USB1Q12208 TIF3YPR163C 1311 nt6.82□□□□□ -1.32
USB1Q12208 EHT1YBR177C 1356 nt6.82□□□□□ -1.32
USB1Q12208 ERG6YML008C 1152 nt6.81□□□□□ -1.32
USB1Q12208 THI73YLR004C 1572 nt6.81□□□□□ -1.32
USB1Q12208 WSC3YOL105C 1671 nt6.81□□□□□ -1.32
USB1Q12208 TGL5YOR081C 2250 nt6.8□□□□□ -1.32
USB1Q12208 ABP1YCR088W 1779 nt6.8□□□□□ -1.32
USB1Q12208 PUP3YER094C 618 nt6.8□□□□□ -1.32
USB1Q12208 INM1YHR046C 888 nt6.8□□□□□ -1.32
USB1Q12208 YPR084WYPR084W 1371 nt6.8□□□□□ -1.32
USB1Q12208 POP2YNR052C 1302 nt6.79□□□□□ -1.32
USB1Q12208 LRO1YNR008W 1986 nt6.79□□□□□ -1.32
USB1Q12208 GLY1YEL046C 1164 nt6.79□□□□□ -1.32
USB1Q12208 YMR206WYMR206W 942 nt6.79□□□□□ -1.32
USB1Q12208 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.78□□□□□ -1.32
USB1Q12208 snR4snR4 186 nt6.78□□□□□ -1.32
USB1Q12208 FTH1YBR207W 1398 nt6.78□□□□□ -1.32
USB1Q12208 DIA4YHR011W 1341 nt6.77□□□□□ -1.32
USB1Q12208 CCR4YAL021C 2514 nt6.77□□□□□ -1.33
USB1Q12208 PMU1YKL128C 888 nt6.76□□□□□ -1.33
USB1Q12208 PRE10YOR362C 867 nt6.75□□□□□ -1.33
USB1Q12208 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.74□□□□□ -1.33
USB1Q12208 YJL160CYJL160C 864 nt6.74□□□□□ -1.33
USB1Q12208 MFT1YML062C 1179 nt6.74□□□□□ -1.33
USB1Q12208 MRP7YNL005C 1116 nt6.74□□□□□ -1.33
USB1Q12208 DIP5YPL265W 1827 nt6.73□□□□□ -1.33
USB1Q12208 ECM27YJR106W 2178 nt6.72□□□□□ -1.33
USB1Q12208 NDE1YMR145C 1683 nt6.72□□□□□ -1.33
USB1Q12208 YER156CYER156C 1017 nt6.72□□□□□ -1.33
USB1Q12208 UFD1YGR048W 1086 nt6.72□□□□□ -1.33
USB1Q12208 ADE16YLR028C 1776 nt6.72□□□□□ -1.33
USB1Q12208 MRN1YPL184C 1839 nt6.71□□□□□ -1.33
USB1Q12208 BXI1YNL305C 894 nt6.71□□□□□ -1.34
USB1Q12208 KTR4YBR199W 1395 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 TIM50YPL063W 1431 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 RPS6AYPL090C 711 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 RPS6BYBR181C 711 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 SHC1YER096W 1539 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 HXT8YJL214W 1710 nt6.7□□□□□ -1.34
USB1Q12208 PET18YCR020C 648 nt6.69□□□□□ -1.34
USB1Q12208 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms