Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 HBS1YKR084C 1836 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 OLA1YBR025C 1185 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 FET5YFL041W 1869 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 THI6YPL214C 1623 nt7.74□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 FRA1YLL029W 2250 nt7.73□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 BUB2YMR055C 921 nt7.73□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 snR86snR86 1004 nt7.72□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 FCY1YPR062W 477 nt7.72□□□□□ -1.17
NMD4Q12129 YMR166CYMR166C 1107 nt7.7□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 MET22YOL064C 1074 nt7.7□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 FIT1YDR534C 1587 nt7.7□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 DUR3YHL016C 2208 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 UFD1YGR048W 1086 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 MGM101YJR144W 810 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 LSP1YPL004C 1026 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 YPL108WYPL108W 507 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 YHR131CYHR131C 2553 nt7.69□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 YBR056WYBR056W 1506 nt7.68□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 SWM1YDR260C 513 nt7.67□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 YMR007WYMR007W 381 nt7.67□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 YPL041CYPL041C 624 nt7.67□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 OCH1YGL038C 1443 nt7.67□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 MEP1YGR121C 1479 nt7.67□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 HXT11YOL156W 1704 nt7.66□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 CAK1YFL029C 1107 nt7.66□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 RCR1YBR005W 642 nt7.65□□□□□ -1.18
NMD4Q12129 PDC6YGR087C 1692 nt7.64□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 RRT14YIL127C 621 nt7.64□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 RNA170RNA170 169 nt7.64□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.63□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YLR072WYLR072W 2082 nt7.63□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YMR210WYMR210W 1350 nt7.62□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 LEA1YPL213W 717 nt7.61□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YIL177CYIL177C 5277 nt7.61□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 LPD1YFL018C 1500 nt7.61□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 DUS3YLR401C 2007 nt7.61□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YPT31YER031C 672 nt7.6□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 HIS3YOR202W 663 nt7.6□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 RHO1YPR165W 630 nt7.6□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 SRM1YGL097W 1449 nt7.6□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 YIA6YIL006W 1122 nt7.59□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 NDE2YDL085W 1638 nt7.59□□□□□ -1.19
NMD4Q12129 ORT1YOR130C 879 nt7.58□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 INO1YJL153C 1602 nt7.58□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 THI73YLR004C 1572 nt7.58□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 YJL160CYJL160C 864 nt7.57□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 NSG2YNL156C 900 nt7.57□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 EHT1YBR177C 1356 nt7.57□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 ABP1YCR088W 1779 nt7.56□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 POP2YNR052C 1302 nt7.55□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 LRO1YNR008W 1986 nt7.55□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 ECM27YJR106W 2178 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 PET18YCR020C 648 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 BUD31YCR063W 474 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 PUP3YER094C 618 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 YGR137WYGR137W 375 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 SOD2YHR008C 702 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 RCF1YML030W 480 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 RIB1YBL033C 1038 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 YMR206WYMR206W 942 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 YPR084WYPR084W 1371 nt7.54□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 ALR1YOL130W 2580 nt7.53□□□□□ -1.2
NMD4Q12129 FTH1YBR207W 1398 nt7.52□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.52□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 TDA4YJR116W 840 nt7.52□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 ADE16YLR028C 1776 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YLR173WYLR173W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 MFT1YML062C 1179 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YNL140CYNL140C 570 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 BXI1YNL305C 894 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 RPS6AYPL090C 711 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 RPS6BYBR181C 711 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 snR4snR4 186 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 TGL5YOR081C 2250 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 TIF3YPR163C 1311 nt7.51□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 INM1YHR046C 888 nt7.5□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 SHC1YER096W 1539 nt7.5□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 WSC3YOL105C 1671 nt7.5□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 GLY1YEL046C 1164 nt7.49□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YER156CYER156C 1017 nt7.49□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 PRE10YOR362C 867 nt7.49□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 DIP5YPL265W 1827 nt7.48□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 HXT8YJL214W 1710 nt7.47□□□□□ -1.21
NMD4Q12129 ERG6YML008C 1152 nt7.46□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 MRP7YNL005C 1116 nt7.46□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 TOM71YHR117W 1920 nt7.46□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 TIM50YPL063W 1431 nt7.45□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 HDA1YNL021W 2121 nt7.45□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 PMU1YKL128C 888 nt7.45□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 YNL190WYNL190W 615 nt7.45□□□□□ -1.22
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