Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 HMG2YLR450W 3138 nt8.64□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 THI3YDL080C 1830 nt8.64□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 KAE1YKR038C 1161 nt8.63□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 DMA2YNL116W 1569 nt8.63□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 MFG1YDL233W 1377 nt8.62□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 TDH1YJL052W 999 nt8.62□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 YJR149WYJR149W 1215 nt8.62□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 BXI1YNL305C 894 nt8.62□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 TOS1YBR162C 1368 nt8.61□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 MDM35YKL053C-A 261 nt8.61□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 TPO4YOR273C 1980 nt8.61□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 PSD1YNL169C 1503 nt8.6□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 YRF1-2YER190W 5046 nt8.59□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 GTB1YDR221W 2109 nt8.59□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 NAS6YGR232W 687 nt8.59□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 TMS1YDR105C 1422 nt8.58□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 ADE1YAR015W 921 nt8.58□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 BUB2YMR055C 921 nt8.58□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 INH1YDL181W 258 nt8.57□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 RNA170RNA170 169 nt8.57□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 RHO1YPR165W 630 nt8.57□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 YMC2YBR104W 990 nt8.57□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 YJL043WYJL043W 774 nt8.56□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 YBL095WYBL095W 813 nt8.56□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 AAC3YBR085W 924 nt8.56□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 LEU4YNL104C 1860 nt8.55□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 ATP2YJR121W 1536 nt8.55□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 YJL009WYJL009W 327 nt8.55□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 FUS3YBL016W 1062 nt8.55□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 PET494YNR045W 1470 nt8.55□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 NUP53YMR153W 1428 nt8.54□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 YHR218WYHR218W 1812 nt8.54□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 MRS4YKR052C 915 nt8.54□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 CYT1YOR065W 930 nt8.54□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 THI73YLR004C 1572 nt8.53□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 HOG1YLR113W 1308 nt8.53□□□□□ -1.04
HFI1Q12060 PRE5YMR314W 705 nt8.52□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 SDH8YBR269C 417 nt8.52□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 URA8YJR103W 1737 nt8.51□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 PMU1YKL128C 888 nt8.51□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 BAP3YDR046C 1815 nt8.51□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 YDR476CYDR476C 675 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 YIL168WYIL168W 384 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 GAL2YLR081W 1725 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 YPL041CYPL041C 624 nt8.5□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 PUP3YER094C 618 nt8.49□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 HXT10YFL011W 1641 nt8.47□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 YHL008CYHL008C 1884 nt8.47□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 TPN1YGL186C 1740 nt8.46□□□□□ -1.05
HFI1Q12060 PRE10YOR362C 867 nt8.46□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 HEM14YER014W 1620 nt8.46□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 TOK1YJL093C 2076 nt8.45□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.44□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.44□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.44□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 YBR056WYBR056W 1506 nt8.43□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 TIM50YPL063W 1431 nt8.42□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 PSP2YML017W 1782 nt8.42□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 SHC1YER096W 1539 nt8.41□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.41□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 JHD1YER051W 1479 nt8.4□□□□□ -1.06
HFI1Q12060 NPP2YEL016C 1482 nt8.39□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 AAT1YKL106W 1356 nt8.39□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 RRT6YGL146C 936 nt8.39□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 COG1YGL223C 1254 nt8.39□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 AGP3YFL055W 1677 nt8.39□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 MEP1YGR121C 1479 nt8.38□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 HAC1YFL031W 717 nt8.37□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 YLR358CYLR358C 564 nt8.37□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 CPT1YNL130C 1182 nt8.37□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 snR86snR86 1004 nt8.36□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 RCF1YML030W 480 nt8.36□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 YPL247CYPL247C 1572 nt8.35□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 EHT1YBR177C 1356 nt8.35□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 SPR1YOR190W 1338 nt8.34□□□□□ -1.07
HFI1Q12060 YIL177CYIL177C 5277 nt8.33□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 YGR137WYGR137W 375 nt8.33□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 PNS1YOR161C 1620 nt8.32□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.32□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 HXT8YJL214W 1710 nt8.32□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 LRO1YNR008W 1986 nt8.31□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 MTO1YGL236C 2010 nt8.29□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 RPR1RPR1 369 nt8.29□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 NDE2YDL085W 1638 nt8.29□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 ARG7YMR062C 1326 nt8.29□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 APT1YML022W 564 nt8.28□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 YML079WYML079W 606 nt8.28□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 NBA1YOL070C 1506 nt8.28□□□□□ -1.08
HFI1Q12060 WSC3YOL105C 1671 nt8.27□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 COS10YNR075W 1125 nt8.25□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 GNP1YDR508C 1992 nt8.24□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 BUD31YCR063W 474 nt8.24□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 FAF1YIL019W 1041 nt8.24□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 INO1YJL153C 1602 nt8.23□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 PUP2YGR253C 783 nt8.23□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 TDA4YJR116W 840 nt8.22□□□□□ -1.09
HFI1Q12060 YTH1YPR107C 627 nt8.21□□□□□ -1.1
HFI1Q12060 FET5YFL041W 1869 nt8.21□□□□□ -1.1
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