Protein–RNA interactions for Protein: Q08280

BSC6, Bypass of stop codon protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC6Q08280 YJR149WYJR149W 1215 nt7.59□□□□□ -1.19
BSC6Q08280 OCH1YGL038C 1443 nt7.59□□□□□ -1.19
BSC6Q08280 YPR084WYPR084W 1371 nt7.59□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 YLR173WYLR173W 1827 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 CHS7YHR142W 951 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 YRF1-2YER190W 5046 nt7.58□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 BAP3YDR046C 1815 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 DPL1YDR294C 1770 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 ADE1YAR015W 921 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 PRE5YMR314W 705 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 SDH8YBR269C 417 nt7.57□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 MET22YOL064C 1074 nt7.56□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 YHR218WYHR218W 1812 nt7.56□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 HXT10YFL011W 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 TPN1YGL186C 1740 nt7.55□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 FUS3YBL016W 1062 nt7.55□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 TOM71YHR117W 1920 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 OLA1YBR025C 1185 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 RPS6AYPL090C 711 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 RPS6BYBR181C 711 nt7.54□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 YJL043WYJL043W 774 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 TDH1YJL052W 999 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 BXI1YNL305C 894 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 PET494YNR045W 1470 nt7.53□□□□□ -1.2
BSC6Q08280 PDC6YGR087C 1692 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 LEU4YNL104C 1860 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 NUP53YMR153W 1428 nt7.51□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 YPL247CYPL247C 1572 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 INH1YDL181W 258 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 Q0010Q0010 387 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 ATP2YJR121W 1536 nt7.5□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 SNU66YOR308C 1764 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 AGP3YFL055W 1677 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 YDR467CYDR467C 327 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 YPT31YER031C 672 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 GGA2YHR108W 1758 nt7.48□□□□□ -1.21
BSC6Q08280 RNA170RNA170 169 nt7.46□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.46□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 ALR1YOL130W 2580 nt7.46□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 YIR035CYIR035C 765 nt7.45□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 THI3YDL080C 1830 nt7.43□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 YDR476CYDR476C 675 nt7.43□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 GPM1YKL152C 744 nt7.43□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 ADE2YOR128C 1716 nt7.42□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.42□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.42□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 YIL168WYIL168W 384 nt7.42□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 RHO1YPR165W 630 nt7.41□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 NPP2YEL016C 1482 nt7.4□□□□□ -1.22
BSC6Q08280 RTG2YGL252C 1767 nt7.4□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 YBL095WYBL095W 813 nt7.38□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 MDL2YPL270W 2322 nt7.38□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 TMS1YDR105C 1422 nt7.37□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 RPR1RPR1 369 nt7.37□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 YMC2YBR104W 990 nt7.37□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 THI6YPL214C 1623 nt7.37□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 RRT6YGL146C 936 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 PMU1YKL128C 888 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 BUB2YMR055C 921 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 AAC3YBR085W 924 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 THI73YLR004C 1572 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 PSP2YML017W 1782 nt7.36□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 NBA1YOL070C 1506 nt7.35□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 PUP3YER094C 618 nt7.34□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 COS10YNR075W 1125 nt7.34□□□□□ -1.23
BSC6Q08280 YLR358CYLR358C 564 nt7.33□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 DUR3YHL016C 2208 nt7.33□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 HAC1YFL031W 717 nt7.32□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 GCD11YER025W 1584 nt7.31□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 MRS4YKR052C 915 nt7.31□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 YOR072WYOR072W 315 nt7.31□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 SHC1YER096W 1539 nt7.31□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 AAT1YKL106W 1356 nt7.31□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 JHD1YER051W 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 TIM50YPL063W 1431 nt7.3□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 YML079WYML079W 606 nt7.3□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 CPT1YNL130C 1182 nt7.3□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 PRE10YOR362C 867 nt7.3□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 PUP2YGR253C 783 nt7.29□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 LPD1YFL018C 1500 nt7.28□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 YJL009WYJL009W 327 nt7.28□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 YEL023CYEL023C 2049 nt7.28□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 FET5YFL041W 1869 nt7.28□□□□□ -1.24
BSC6Q08280 MAM3YOL060C 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 TRP2YER090W 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YBR056WYBR056W 1506 nt7.27□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 SPR1YOR190W 1338 nt7.27□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YJL045WYJL045W 1905 nt7.26□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 PNS1YOR161C 1620 nt7.26□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 MEP1YGR121C 1479 nt7.24□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.24□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.22□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 MEX67YPL169C 1800 nt7.22□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 URA1YKL216W 945 nt7.22□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 LAT1YNL071W 1449 nt7.21□□□□□ -1.25
BSC6Q08280 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.21□□□□□ -1.26
BSC6Q08280 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.21□□□□□ -1.26
BSC6Q08280 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms