Protein–RNA interactions for Protein: Q06164

MMS22, E3 ubiquitin-protein ligase substrate receptor MMS22, yeastyeast

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS22Q06164 YDR476CYDR476C 675 nt12.46□□□□□ -0.41
MMS22Q06164 URA1YKL216W 945 nt12.46□□□□□ -0.41
MMS22Q06164 SPG1YGR236C 288 nt12.45□□□□□ -0.42
MMS22Q06164 NPP2YEL016C 1482 nt12.43□□□□□ -0.42
MMS22Q06164 PSD1YNL169C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
MMS22Q06164 YMC2YBR104W 990 nt12.4□□□□□ -0.42
MMS22Q06164 AGP3YFL055W 1677 nt12.4□□□□□ -0.42
MMS22Q06164 YJL225CYJL225C 5277 nt12.39□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 ATP2YJR121W 1536 nt12.39□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 YJL009WYJL009W 327 nt12.38□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 AAT1YKL106W 1356 nt12.38□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 PDC6YGR087C 1692 nt12.37□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 YPT31YER031C 672 nt12.37□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 AAC3YBR085W 924 nt12.37□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 SHC1YER096W 1539 nt12.36□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 RHO1YPR165W 630 nt12.34□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 RNA170RNA170 169 nt12.34□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 OLA1YBR025C 1185 nt12.34□□□□□ -0.43
MMS22Q06164 MEP1YGR121C 1479 nt12.33□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 TMS1YDR105C 1422 nt12.32□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 DOC1YGL240W 753 nt12.32□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt12.31□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 YHR218WYHR218W 1812 nt12.3□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt12.3□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 MRS4YKR052C 915 nt12.3□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 snR86snR86 1004 nt12.29□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 YOR111WYOR111W 699 nt12.29□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 PSP2YML017W 1782 nt12.29□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 KRR1YCL059C 951 nt12.28□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 SLM3YDL033C 1254 nt12.28□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 YJL144WYJL144W 315 nt12.28□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 MAS2YHR024C 1449 nt12.28□□□□□ -0.44
MMS22Q06164 INH1YDL181W 258 nt12.27□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 TPN1YGL186C 1740 nt12.26□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 LAT1YNL071W 1449 nt12.26□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 THI73YLR004C 1572 nt12.25□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 PIH1YHR034C 1035 nt12.25□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 MTO1YGL236C 2010 nt12.25□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 HEL2YDR266C 1920 nt12.23□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 BUB2YMR055C 921 nt12.23□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 TRP2YER090W 1524 nt12.23□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 YBR056WYBR056W 1506 nt12.22□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 CYS3YAL012W 1185 nt12.21□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 APT1YML022W 564 nt12.21□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 YOX1YML027W 1158 nt12.21□□□□□ -0.45
MMS22Q06164 UME1YPL139C 1383 nt12.21□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 SPR1YOR190W 1338 nt12.2□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 PNS1YOR161C 1620 nt12.2□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 ATP23YNR020C 813 nt12.2□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 CPT1YNL130C 1182 nt12.18□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 CYT1YOR065W 930 nt12.17□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 ESBP6YNL125C 2022 nt12.16□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 THI6YPL214C 1623 nt12.16□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 FET5YFL041W 1869 nt12.15□□□□□ -0.46
MMS22Q06164 PUP3YER094C 618 nt12.14□□□□□ -0.47
MMS22Q06164 YIR035CYIR035C 765 nt12.14□□□□□ -0.47
MMS22Q06164 YBL111CYBL111C 2004 nt12.14□□□□□ -0.47
MMS22Q06164 PUS4YNL292W 1212 nt12.13□□□□□ -0.47
MMS22Q06164 JHD1YER051W 1479 nt12.12□□□□□ -0.47
MMS22Q06164 SRM1YGL097W 1449 nt12.08□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 HXT8YJL214W 1710 nt12.07□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 LRO1YNR008W 1986 nt12.05□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 HXT11YOL156W 1704 nt12.04□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 TIM50YPL063W 1431 nt12.04□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 AIM46YHR199C 933 nt12.04□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 POR2YIL114C 846 nt12.03□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 SPE3YPR069C 882 nt12.02□□□□□ -0.48
MMS22Q06164 INO1YJL153C 1602 nt12.02□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 PMU1YKL128C 888 nt12.02□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 ALG7YBR243C 1347 nt12.01□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 BUD31YCR063W 474 nt12□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.99□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 PRE10YOR362C 867 nt11.99□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 MAE1YKL029C 2010 nt11.98□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 ABP1YCR088W 1779 nt11.98□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 GAL83YER027C 1254 nt11.98□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 CST26YBR042C 1194 nt11.98□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 MCP1YOR228C 909 nt11.97□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 RCF1YML030W 480 nt11.96□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 DIP5YPL265W 1827 nt11.96□□□□□ -0.49
MMS22Q06164 TPO4YOR273C 1980 nt11.96□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 ZIM17YNL310C 525 nt11.95□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 HIS3YOR202W 663 nt11.95□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 YPQ1YOL092W 927 nt11.95□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 NBA1YOL070C 1506 nt11.94□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 YLR072WYLR072W 2082 nt11.93□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 AVO2YMR068W 1281 nt11.93□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 MBF1YOR298C-A 456 nt11.93□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 CRN1YLR429W 1956 nt11.92□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 PLB3YOL011W 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 PMP3YDR276C 168 nt11.91□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 ADH6YMR318C 1083 nt11.91□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 TRR2YHR106W 1029 nt11.9□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 EHT1YBR177C 1356 nt11.9□□□□□ -0.5
MMS22Q06164 FTH1YBR207W 1398 nt11.89□□□□□ -0.51
MMS22Q06164 PTH2YBL057C 627 nt11.87□□□□□ -0.51
MMS22Q06164 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt11.86□□□□□ -0.51
MMS22Q06164 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt11.86□□□□□ -0.51
MMS22Q06164 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt11.86□□□□□ -0.51
MMS22Q06164 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt11.86□□□□□ -0.51
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