Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 POP2YNR052C 1302 nt9.22□□□□□ -0.93
GDE1Q02979 YPL108WYPL108W 507 nt9.2□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 KDX1YKL161C 1302 nt9.2□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 MRS4YKR052C 915 nt9.19□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 RCR1YBR005W 642 nt9.19□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 SNU66YOR308C 1764 nt9.18□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 AAC3YBR085W 924 nt9.18□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 YMR166CYMR166C 1107 nt9.17□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 TMS1YDR105C 1422 nt9.15□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 TPN1YGL186C 1740 nt9.15□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 CHS7YHR142W 951 nt9.15□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 LSP1YPL004C 1026 nt9.15□□□□□ -0.94
GDE1Q02979 RTG2YGL252C 1767 nt9.14□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 AAT1YKL106W 1356 nt9.14□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 YIR035CYIR035C 765 nt9.14□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 YJR149WYJR149W 1215 nt9.14□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 BUD20YLR074C 501 nt9.14□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 THI6YPL214C 1623 nt9.13□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 YJL009WYJL009W 327 nt9.13□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 MET22YOL064C 1074 nt9.13□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 OLA1YBR025C 1185 nt9.13□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 CAK1YFL029C 1107 nt9.11□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 BUB2YMR055C 921 nt9.11□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 OCH1YGL038C 1443 nt9.11□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 ADE2YOR128C 1716 nt9.11□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 BNS1YGR230W 414 nt9.1□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.1□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 DUR3YHL016C 2208 nt9.09□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 MTO1YGL236C 2010 nt9.09□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 YJL160CYJL160C 864 nt9.09□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 ATG17YLR423C 1254 nt9.09□□□□□ -0.95
GDE1Q02979 GCD11YER025W 1584 nt9.08□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 REC114YMR133W 1287 nt9.08□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 RRT14YIL127C 621 nt9.07□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 RNA170RNA170 169 nt9.07□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 EMC3YKL207W 762 nt9.06□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 PDC6YGR087C 1692 nt9.06□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 PET18YCR020C 648 nt9.05□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 snR86snR86 1004 nt9.05□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 RMA1YKL132C 1293 nt9.05□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 ALR1YOL130W 2580 nt9.05□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 YMR210WYMR210W 1350 nt9.04□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 YBR056WYBR056W 1506 nt9.04□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 TRP2YER090W 1524 nt9.03□□□□□ -0.96
GDE1Q02979 NBA1YOL070C 1506 nt9.02□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 GRH1YDR517W 1119 nt9.02□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 IDP3YNL009W 1263 nt9.02□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 MEP1YGR121C 1479 nt9.02□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 CBK1YNL161W 2271 nt9.01□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 RHO1YPR165W 630 nt9.01□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 ATG22YCL038C 1587 nt9.01□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 FET5YFL041W 1869 nt9□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YPT31YER031C 672 nt8.99□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YHM2YMR241W 945 nt8.99□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 MAM3YOL060C 2121 nt8.99□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YOR343CYOR343C 327 nt8.98□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YPR084WYPR084W 1371 nt8.98□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 MLS1YNL117W 1665 nt8.97□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 RPS6AYPL090C 711 nt8.97□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 RPS6BYBR181C 711 nt8.97□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 THI73YLR004C 1572 nt8.97□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YHL008CYHL008C 1884 nt8.96□□□□□ -0.97
GDE1Q02979 YER156CYER156C 1017 nt8.96□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 HRA1HRA1 564 nt8.96□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 MFT1YML062C 1179 nt8.96□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 BXI1YNL305C 894 nt8.96□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 YMR206WYMR206W 942 nt8.95□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 HXT11YOL156W 1704 nt8.94□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 UTR5YEL035C 501 nt8.94□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 PUP3YER094C 618 nt8.93□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 YEL023CYEL023C 2049 nt8.93□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 SHC1YER096W 1539 nt8.92□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.92□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 MDL2YPL270W 2322 nt8.91□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 YLR072WYLR072W 2082 nt8.91□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 EHT1YBR177C 1356 nt8.9□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 PAM17YKR065C 594 nt8.9□□□□□ -0.98
GDE1Q02979 HXK1YFR053C 1458 nt8.89□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 ADA2YDR448W 1305 nt8.89□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YNL165WYNL165W 1221 nt8.89□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 HIS3YOR202W 663 nt8.89□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 LRO1YNR008W 1986 nt8.89□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 INO1YJL153C 1602 nt8.88□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 MRP1YDR347W 966 nt8.88□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 RCF1YML030W 480 nt8.88□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 LEA1YPL213W 717 nt8.88□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YHR131CYHR131C 2553 nt8.88□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 RPL12BYDR418W 498 nt8.87□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.87□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 SRM1YGL097W 1449 nt8.87□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 BUD31YCR063W 474 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.86□□□□□ -0.99
GDE1Q02979 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms