Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad1P70340 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad1P70340 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad1P70340 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad1P70340 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad1P70340 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad1P70340 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad1P70340 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad1P70340 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad1P70340 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad1P70340 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad1P70340 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad1P70340 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad1P70340 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad1P70340 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad1P70340 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms