Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFRD-1P60508 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFRD-1P60508 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFRD-1P60508 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVFRD-1P60508 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVFRD-1P60508 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms