Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUMO3P55854 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUMO3P55854 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUMO3P55854 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUMO3P55854 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms