Protein–RNA interactions for Protein: P53955

SLM2, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate-binding protein SLM2, yeastyeast

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM2P53955 RNA170RNA170 169 nt7.85□□□□□ -1.15
SLM2P53955 DIA4YHR011W 1341 nt7.84□□□□□ -1.15
SLM2P53955 TIF3YPR163C 1311 nt7.84□□□□□ -1.15
SLM2P53955 SER2YGR208W 930 nt7.84□□□□□ -1.15
SLM2P53955 ADE16YLR028C 1776 nt7.84□□□□□ -1.15
SLM2P53955 INM1YHR046C 888 nt7.83□□□□□ -1.16
SLM2P53955 EHT1YBR177C 1356 nt7.83□□□□□ -1.16
SLM2P53955 GLY1YEL046C 1164 nt7.82□□□□□ -1.16
SLM2P53955 DUS3YLR401C 2007 nt7.82□□□□□ -1.16
SLM2P53955 TGL5YOR081C 2250 nt7.82□□□□□ -1.16
SLM2P53955 LRO1YNR008W 1986 nt7.82□□□□□ -1.16
SLM2P53955 OCH1YGL038C 1443 nt7.81□□□□□ -1.16
SLM2P53955 YGR210CYGR210C 1236 nt7.81□□□□□ -1.16
SLM2P53955 TDA4YJR116W 840 nt7.81□□□□□ -1.16
SLM2P53955 PDC6YGR087C 1692 nt7.81□□□□□ -1.16
SLM2P53955 POP2YNR052C 1302 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 CAK1YFL029C 1107 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 YMR166CYMR166C 1107 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 PAU19YMR325W 375 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 RHO1YPR165W 630 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 HTS1YPR033C 1641 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 MRN1YPL184C 1839 nt7.8□□□□□ -1.16
SLM2P53955 THI73YLR004C 1572 nt7.79□□□□□ -1.16
SLM2P53955 YGR137WYGR137W 375 nt7.78□□□□□ -1.16
SLM2P53955 LSP1YPL004C 1026 nt7.78□□□□□ -1.16
SLM2P53955 TOK1YJL093C 2076 nt7.78□□□□□ -1.16
SLM2P53955 DIP5YPL265W 1827 nt7.78□□□□□ -1.16
SLM2P53955 DTR1YBR180W 1719 nt7.78□□□□□ -1.16
SLM2P53955 NAP1YKR048C 1254 nt7.77□□□□□ -1.17
SLM2P53955 RCF1YML030W 480 nt7.77□□□□□ -1.17
SLM2P53955 MRP7YNL005C 1116 nt7.77□□□□□ -1.17
SLM2P53955 FCY1YPR062W 477 nt7.77□□□□□ -1.17
SLM2P53955 RFC1YOR217W 2586 nt7.77□□□□□ -1.17
SLM2P53955 YPT31YER031C 672 nt7.75□□□□□ -1.17
SLM2P53955 YPL108WYPL108W 507 nt7.75□□□□□ -1.17
SLM2P53955 WSC3YOL105C 1671 nt7.75□□□□□ -1.17
SLM2P53955 FIT1YDR534C 1587 nt7.75□□□□□ -1.17
SLM2P53955 MDH2YOL126C 1134 nt7.74□□□□□ -1.17
SLM2P53955 KTR4YBR199W 1395 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 PUP3YER094C 618 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 UFD1YGR048W 1086 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 RRT14YIL127C 621 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 SHC1YER096W 1539 nt7.73□□□□□ -1.17
SLM2P53955 PFS2YNL317W 1398 nt7.72□□□□□ -1.17
SLM2P53955 ARO3YDR035W 1113 nt7.72□□□□□ -1.17
SLM2P53955 WSC4YHL028W 1818 nt7.71□□□□□ -1.17
SLM2P53955 HSV2YGR223C 1347 nt7.71□□□□□ -1.18
SLM2P53955 ALG7YBR243C 1347 nt7.71□□□□□ -1.18
SLM2P53955 HXT8YJL214W 1710 nt7.69□□□□□ -1.18
SLM2P53955 SNP1YIL061C 903 nt7.68□□□□□ -1.18
SLM2P53955 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.67□□□□□ -1.18
SLM2P53955 SAM50YNL026W 1455 nt7.67□□□□□ -1.18
SLM2P53955 PRE10YOR362C 867 nt7.66□□□□□ -1.18
SLM2P53955 MTC6YHR151C 1581 nt7.66□□□□□ -1.18
SLM2P53955 YMR206WYMR206W 942 nt7.64□□□□□ -1.19
SLM2P53955 SLG1YOR008C 1137 nt7.64□□□□□ -1.19
SLM2P53955 PUP1YOR157C 786 nt7.64□□□□□ -1.19
SLM2P53955 PMT7YDR307W 1989 nt7.64□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YCP4YCR004C 744 nt7.63□□□□□ -1.19
SLM2P53955 SLM3YDL033C 1254 nt7.63□□□□□ -1.19
SLM2P53955 ELP6YMR312W 822 nt7.63□□□□□ -1.19
SLM2P53955 BXI1YNL305C 894 nt7.63□□□□□ -1.19
SLM2P53955 TIM50YPL063W 1431 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YPR084WYPR084W 1371 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 PET18YCR020C 648 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 SWM1YDR260C 513 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 RPS6AYPL090C 711 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 RPS6BYBR181C 711 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 LPD1YFL018C 1500 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 MET13YGL125W 1803 nt7.62□□□□□ -1.19
SLM2P53955 MNN9YPL050C 1188 nt7.61□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.6□□□□□ -1.19
SLM2P53955 TES1YJR019C 1050 nt7.6□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YMR007WYMR007W 381 nt7.6□□□□□ -1.19
SLM2P53955 JHD1YER051W 1479 nt7.6□□□□□ -1.19
SLM2P53955 YJL160CYJL160C 864 nt7.59□□□□□ -1.19
SLM2P53955 CDA1YLR307W 906 nt7.59□□□□□ -1.19
SLM2P53955 AVL9YLR114C 2295 nt7.58□□□□□ -1.2
SLM2P53955 ARG7YMR062C 1326 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 CKB1YGL019W 837 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 PMU1YKL128C 888 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 YPL264CYPL264C 1062 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 RSC9YML127W 1746 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 ALR1YOL130W 2580 nt7.57□□□□□ -1.2
SLM2P53955 YER156CYER156C 1017 nt7.56□□□□□ -1.2
SLM2P53955 RCR1YBR005W 642 nt7.56□□□□□ -1.2
SLM2P53955 TPO1YLL028W 1761 nt7.56□□□□□ -1.2
SLM2P53955 TOM71YHR117W 1920 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM2P53955 HAM1YJR069C 594 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM2P53955 AOS1YPR180W 1044 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM2P53955 HEM14YER014W 1620 nt7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.4 ms