Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOVA1P51513 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOVA1P51513 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NOVA1P51513 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOVA1P51513 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms