Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcls1P49710 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcls1P49710 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcls1P49710 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hcls1P49710 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms