Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX2P40425 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX2P40425 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX2P40425 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX2P40425 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX2P40425 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX2P40425 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX2P40425 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX2P40425 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX2P40425 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX2P40425 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX2P40425 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX2P40425 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PBX2P40425 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX2P40425 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX2P40425 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX2P40425 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX2P40425 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX2P40425 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX2P40425 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX2P40425 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX2P40425 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX2P40425 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBX2P40425 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX2P40425 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX2P40425 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX2P40425 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX2P40425 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX2P40425 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX2P40425 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX2P40425 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX2P40425 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX2P40425 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX2P40425 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX2P40425 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX2P40425 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX2P40425 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX2P40425 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX2P40425 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX2P40425 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX2P40425 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX2P40425 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX2P40425 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX2P40425 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX2P40425 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX2P40425 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX2P40425 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX2P40425 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX2P40425 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX2P40425 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX2P40425 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX2P40425 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX2P40425 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX2P40425 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX2P40425 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX2P40425 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX2P40425 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX2P40425 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX2P40425 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX2P40425 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX2P40425 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX2P40425 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX2P40425 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX2P40425 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX2P40425 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX2P40425 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX2P40425 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX2P40425 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX2P40425 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX2P40425 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX2P40425 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX2P40425 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX2P40425 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX2P40425 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX2P40425 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX2P40425 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX2P40425 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX2P40425 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX2P40425 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX2P40425 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX2P40425 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms