Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH11P35749 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH11P35749 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH11P35749 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH11P35749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH11P35749 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH11P35749 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH11P35749 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH11P35749 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH11P35749 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH11P35749 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH11P35749 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH11P35749 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH11P35749 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH11P35749 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH11P35749 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH11P35749 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH11P35749 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH11P35749 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH11P35749 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH11P35749 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH11P35749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH11P35749 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH11P35749 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH11P35749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH11P35749 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH11P35749 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH11P35749 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH11P35749 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH11P35749 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH11P35749 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH11P35749 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH11P35749 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH11P35749 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH11P35749 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH11P35749 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH11P35749 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH11P35749 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH11P35749 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH11P35749 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH11P35749 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH11P35749 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH11P35749 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH11P35749 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH11P35749 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms