Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTGS1P23219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTGS1P23219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTGS1P23219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms