Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCP2P22307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCP2P22307 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCP2P22307 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCP2P22307 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCP2P22307 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCP2P22307 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCP2P22307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCP2P22307 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCP2P22307 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCP2P22307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCP2P22307 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCP2P22307 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCP2P22307 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCP2P22307 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCP2P22307 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCP2P22307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCP2P22307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCP2P22307 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCP2P22307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCP2P22307 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCP2P22307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCP2P22307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCP2P22307 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCP2P22307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCP2P22307 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCP2P22307 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCP2P22307 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCP2P22307 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCP2P22307 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCP2P22307 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCP2P22307 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCP2P22307 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCP2P22307 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCP2P22307 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCP2P22307 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCP2P22307 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCP2P22307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCP2P22307 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCP2P22307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCP2P22307 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCP2P22307 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCP2P22307 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCP2P22307 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCP2P22307 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCP2P22307 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCP2P22307 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCP2P22307 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCP2P22307 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCP2P22307 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCP2P22307 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCP2P22307 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCP2P22307 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCP2P22307 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCP2P22307 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCP2P22307 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCP2P22307 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCP2P22307 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCP2P22307 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCP2P22307 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCP2P22307 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCP2P22307 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCP2P22307 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCP2P22307 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCP2P22307 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCP2P22307 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCP2P22307 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCP2P22307 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCP2P22307 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCP2P22307 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCP2P22307 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCP2P22307 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms