Protein–RNA interactions for Protein: P20434

RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, yeastyeast

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB5P20434 YLR072WYLR072W 2082 nt7.39□□□□□ -1.23
RPB5P20434 RHO1YPR165W 630 nt7.39□□□□□ -1.23
RPB5P20434 YPT31YER031C 672 nt7.38□□□□□ -1.23
RPB5P20434 YMR210WYMR210W 1350 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 HEM14YER014W 1620 nt7.37□□□□□ -1.23
RPB5P20434 PET18YCR020C 648 nt7.36□□□□□ -1.23
RPB5P20434 HIS3YOR202W 663 nt7.36□□□□□ -1.23
RPB5P20434 MEX67YPL169C 1800 nt7.36□□□□□ -1.23
RPB5P20434 YPR084WYPR084W 1371 nt7.35□□□□□ -1.23
RPB5P20434 THI73YLR004C 1572 nt7.35□□□□□ -1.23
RPB5P20434 PUP3YER094C 618 nt7.35□□□□□ -1.23
RPB5P20434 LEA1YPL213W 717 nt7.35□□□□□ -1.23
RPB5P20434 MDL2YPL270W 2322 nt7.35□□□□□ -1.23
RPB5P20434 NDE2YDL085W 1638 nt7.34□□□□□ -1.23
RPB5P20434 TOM71YHR117W 1920 nt7.34□□□□□ -1.23
RPB5P20434 SRM1YGL097W 1449 nt7.34□□□□□ -1.23
RPB5P20434 EHT1YBR177C 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 BUD31YCR063W 474 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 YER156CYER156C 1017 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 ERG6YML008C 1152 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 RCF1YML030W 480 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 MFT1YML062C 1179 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 YMR206WYMR206W 942 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 MIM1YOL026C 342 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 LRO1YNR008W 1986 nt7.33□□□□□ -1.24
RPB5P20434 ALR1YOL130W 2580 nt7.32□□□□□ -1.24
RPB5P20434 INO1YJL153C 1602 nt7.32□□□□□ -1.24
RPB5P20434 BXI1YNL305C 894 nt7.32□□□□□ -1.24
RPB5P20434 ABP1YCR088W 1779 nt7.31□□□□□ -1.24
RPB5P20434 RPS6AYPL090C 711 nt7.31□□□□□ -1.24
RPB5P20434 RPS6BYBR181C 711 nt7.31□□□□□ -1.24
RPB5P20434 YGR137WYGR137W 375 nt7.3□□□□□ -1.24
RPB5P20434 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.3□□□□□ -1.24
RPB5P20434 ORT1YOR130C 879 nt7.3□□□□□ -1.24
RPB5P20434 SHC1YER096W 1539 nt7.3□□□□□ -1.24
RPB5P20434 TDA4YJR116W 840 nt7.29□□□□□ -1.24
RPB5P20434 HBS1YKR084C 1836 nt7.29□□□□□ -1.24
RPB5P20434 PRE10YOR362C 867 nt7.28□□□□□ -1.24
RPB5P20434 WSC3YOL105C 1671 nt7.28□□□□□ -1.24
RPB5P20434 TIF3YPR163C 1311 nt7.27□□□□□ -1.24
RPB5P20434 TGL5YOR081C 2250 nt7.27□□□□□ -1.24
RPB5P20434 PMU1YKL128C 888 nt7.27□□□□□ -1.25
RPB5P20434 YNL140CYNL140C 570 nt7.27□□□□□ -1.25
RPB5P20434 DIP5YPL265W 1827 nt7.27□□□□□ -1.25
RPB5P20434 TIM50YPL063W 1431 nt7.27□□□□□ -1.25
RPB5P20434 UTR5YEL035C 501 nt7.26□□□□□ -1.25
RPB5P20434 GLY1YEL046C 1164 nt7.26□□□□□ -1.25
RPB5P20434 INM1YHR046C 888 nt7.26□□□□□ -1.25
RPB5P20434 HXT8YJL214W 1710 nt7.26□□□□□ -1.25
RPB5P20434 POP2YNR052C 1302 nt7.26□□□□□ -1.25
RPB5P20434 FTH1YBR207W 1398 nt7.25□□□□□ -1.25
RPB5P20434 GRH1YDR517W 1119 nt7.25□□□□□ -1.25
RPB5P20434 ATP2YJR121W 1536 nt7.25□□□□□ -1.25
RPB5P20434 FRA1YLL029W 2250 nt7.25□□□□□ -1.25
RPB5P20434 ADA2YDR448W 1305 nt7.25□□□□□ -1.25
RPB5P20434 LPD1YFL018C 1500 nt7.23□□□□□ -1.25
RPB5P20434 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.23□□□□□ -1.25
RPB5P20434 JHD1YER051W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
RPB5P20434 NSG2YNL156C 900 nt7.22□□□□□ -1.25
RPB5P20434 MRP1YDR347W 966 nt7.21□□□□□ -1.26
RPB5P20434 UFD1YGR048W 1086 nt7.21□□□□□ -1.26
RPB5P20434 MRP7YNL005C 1116 nt7.21□□□□□ -1.26
RPB5P20434 GDH1YOR375C 1365 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 MRN1YPL184C 1839 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 TDH1YJL052W 999 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 snR4snR4 186 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 ALG7YBR243C 1347 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 DUR3YHL016C 2208 nt7.2□□□□□ -1.26
RPB5P20434 ARO3YDR035W 1113 nt7.19□□□□□ -1.26
RPB5P20434 YIL168WYIL168W 384 nt7.19□□□□□ -1.26
RPB5P20434 TAD2YJL035C 753 nt7.19□□□□□ -1.26
RPB5P20434 ELP4YPL101W 1371 nt7.19□□□□□ -1.26
RPB5P20434 WSC4YHL028W 1818 nt7.18□□□□□ -1.26
RPB5P20434 PAU21YOR394W 495 nt7.18□□□□□ -1.26
RPB5P20434 PAU22YPL282C 495 nt7.18□□□□□ -1.26
RPB5P20434 ARG7YMR062C 1326 nt7.18□□□□□ -1.26
RPB5P20434 HRA1HRA1 564 nt7.17□□□□□ -1.26
RPB5P20434 DIA4YHR011W 1341 nt7.17□□□□□ -1.26
RPB5P20434 SNP1YIL061C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
RPB5P20434 KTR4YBR199W 1395 nt7.16□□□□□ -1.26
RPB5P20434 FIT1YDR534C 1587 nt7.14□□□□□ -1.27
RPB5P20434 BUD20YLR074C 501 nt7.14□□□□□ -1.27
RPB5P20434 YOR343CYOR343C 327 nt7.14□□□□□ -1.27
RPB5P20434 MNN9YPL050C 1188 nt7.13□□□□□ -1.27
RPB5P20434 RSC4YKR008W 1878 nt7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms