Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD53P19397 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD53P19397 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD53P19397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD53P19397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD53P19397 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD53P19397 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD53P19397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD53P19397 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD53P19397 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD53P19397 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD53P19397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD53P19397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD53P19397 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD53P19397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD53P19397 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD53P19397 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD53P19397 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD53P19397 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD53P19397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD53P19397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD53P19397 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD53P19397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD53P19397 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD53P19397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD53P19397 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD53P19397 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD53P19397 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD53P19397 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD53P19397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD53P19397 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD53P19397 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD53P19397 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD53P19397 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD53P19397 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD53P19397 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD53P19397 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD53P19397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD53P19397 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD53P19397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD53P19397 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD53P19397 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD53P19397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD53P19397 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD53P19397 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD53P19397 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD53P19397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD53P19397 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD53P19397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD53P19397 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD53P19397 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD53P19397 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD53P19397 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD53P19397 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD53P19397 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD53P19397 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD53P19397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD53P19397 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD53P19397 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD53P19397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD53P19397 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD53P19397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD53P19397 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD53P19397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD53P19397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD53P19397 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD53P19397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms