Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RALAP11233 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RALAP11233 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RALAP11233 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RALAP11233 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RALAP11233 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RALAP11233 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RALAP11233 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RALAP11233 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RALAP11233 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RALAP11233 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALAP11233 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALAP11233 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RALAP11233 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RALAP11233 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RALAP11233 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RALAP11233 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALAP11233 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALAP11233 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALAP11233 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RALAP11233 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RALAP11233 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RALAP11233 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RALAP11233 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RALAP11233 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RALAP11233 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RALAP11233 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RALAP11233 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RALAP11233 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RALAP11233 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RALAP11233 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RALAP11233 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RALAP11233 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RALAP11233 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RALAP11233 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RALAP11233 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALAP11233 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALAP11233 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RALAP11233 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RALAP11233 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RALAP11233 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RALAP11233 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RALAP11233 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RALAP11233 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RALAP11233 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RALAP11233 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RALAP11233 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RALAP11233 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RALAP11233 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RALAP11233 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALAP11233 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALAP11233 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALAP11233 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALAP11233 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RALAP11233 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RALAP11233 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RALAP11233 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RALAP11233 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RALAP11233 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RALAP11233 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RALAP11233 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RALAP11233 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RALAP11233 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RALAP11233 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RALAP11233 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RALAP11233 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RALAP11233 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALAP11233 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RALAP11233 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALAP11233 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RALAP11233 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RALAP11233 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RALAP11233 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RALAP11233 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms