Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFHP08603 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFHP08603 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFHP08603 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFHP08603 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFHP08603 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFHP08603 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFHP08603 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFHP08603 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFHP08603 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFHP08603 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFHP08603 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFHP08603 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFHP08603 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFHP08603 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFHP08603 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFHP08603 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFHP08603 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFHP08603 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFHP08603 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFHP08603 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFHP08603 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFHP08603 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFHP08603 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFHP08603 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFHP08603 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFHP08603 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFHP08603 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFHP08603 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFHP08603 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFHP08603 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFHP08603 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFHP08603 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFHP08603 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFHP08603 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFHP08603 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFHP08603 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFHP08603 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFHP08603 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFHP08603 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFHP08603 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFHP08603 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFHP08603 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFHP08603 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFHP08603 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFHP08603 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFHP08603 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFHP08603 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CFHP08603 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFHP08603 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFHP08603 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFHP08603 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFHP08603 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CFHP08603 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFHP08603 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFHP08603 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFHP08603 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CFHP08603 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFHP08603 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFHP08603 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFHP08603 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFHP08603 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFHP08603 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFHP08603 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFHP08603 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFHP08603 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFHP08603 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFHP08603 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFHP08603 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFHP08603 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFHP08603 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFHP08603 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFHP08603 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFHP08603 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFHP08603 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFHP08603 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFHP08603 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFHP08603 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFHP08603 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFHP08603 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFHP08603 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms